西伯利亚足球俱乐部成立于1936年，1992开始参加俄罗斯国内联赛。2005年升入俄甲，此后的5年西伯利亚一直在俄甲联赛打拼。2009赛季，西伯利亚积73分获得俄甲的第2名成功冲超。